- 博德研究所(Broad Institute)将与因美纳合作开展运用全新空间组学技术的旗舰项目
- AGBT会议期间,因美纳客户将展示在肺纤维化、前列腺癌和小鼠大脑三维重建等研究中的超大规模和高灵敏度数据
- 因美纳拓展软件产品线,以Illumina Connected Multiomics解码多模态数据
加利福尼亚州圣迭戈2025年2月20日 /美通社/ -- 2025年2月19日,因美纳公司(纳斯达克股票代码:ILMN)宣布推出一项全新的空间组学技术项目,将帮助研究人员以前所未有的规模绘制复杂组织图谱,并深入了解细胞行为。这项技术将在因美纳测序仪和全新多模态分析平台上实现,提供具有细胞分辨率和高灵敏度的无偏全转录组分析。这些性能将有望推动空间组学研究的拓展,并开启此前无法实现的应用和实验。
下周于美国佛罗里达州举行的基因组生物学技术进展大会(AGBT)期间,因美纳公司将在研讨会上公布该技术相关细节和早期试用客户数据。
因美纳首席技术官Steve Barnard博士表示:"空间转录组学为深入了解生物细胞功能开辟了全新路径。因美纳的空间组学技术将在我们先进的测序平台上提供完整的工作流程。凭借这一创新,我们将树立新的标杆,有望推动新一轮科学发现的浪潮,进一步解锁更深层次的生物学认知——从细胞间相互作用对疾病的影响到解决这些问题所需的机制。"
空间转录组学使研究人员能够在细胞层面探索生物学的相互作用。例如,通过绘制细胞的详细排列图的"细胞图谱",研究人员可以在影响疾病的复杂组织结构方面获得全新洞察。这也为肿瘤微环境、疾病通路、神经生物学、免疫肿瘤学等领域的发现提供了新的可能。
因美纳空间组学技术拟于2026年进行商业发布,它将能够让研究人员在单次实验中观测数百万个细胞的空间邻近关系,其捕获区域面积将是现有技术的九倍,分辨率则高出四倍。通过让研究人员在单次空间实验中分析更多细胞,该技术不仅能识别稀有细胞群,还能提高统计效能,从而增强研究结果的可靠性。作为一项端到端解决方案,它还将以更具经济性的价格为单细胞和空间组学研究人员创造更大价值。该空间组学解决方案在规模和精确度方面均超越行业标准,并与因美纳的NextSeq和NovaSeq系列测序仪兼容,从而大幅降低了大规模项目的运行成本。
全新多模态分析平台提供有力洞察和可视化功能
这项空间组学技术将与全新软件平台Illumina Connected Multiomics(ICM)配合使用。ICM是一个多模态分析平台,旨在帮助研究人员轻松可视化空间实验的结果。ICM帮助研究人员导航、探索和分析多组学数据集,以驱动更加深刻的生物学数据洞察。其直观的设计和与测序工作流程的无缝集成,将使任何科学家都能在一个平台上实现有力的统计洞察和交互式可视化,以解码多种复杂模态,如基因组学、蛋白质组学、空间转录组学、表观遗传学和单细胞数据等。
因美纳全球软件与信息学负责人Rami Mehio表示:"Illumina Connected Multiomics将实现从样本到分析的无缝工作流程,提供加速生命科学突破所需的强大可视化和统计分析工具。"
博德研究所与因美纳宣布合作启动空间组学旗舰项目
2月19日,博德研究所(Broad Institute)与因美纳共同宣布,双方将运用因美纳的先进空间组学技术,合作开展一项突破性的空间组学旗舰项目。该项目将在博德研究所的空间组学技术平台(STP)进行,测序工作则将在博德研究所的Broad Clinical Labs完成。
因美纳先进的空间组学技术提供了 50 mm*15 mm的广阔成像区域,提高了灵活性、灵敏度、分辨率和无偏全转录组发现能力。基于该技术,空间组学旗舰项目致力于展示大规模空间数据集的变革性潜力。这项合作将从博德研究所主要研究人员提供的数百个样本中生成大规模的协调数据,旨在推动空间组学技术市场的更多发现。此外,该项目还将通过博德研究所的STP渠道,向外部研究团队提供因美纳空间组学技术的早期试用机会,以促进更广泛的参与并加速创新。
因美纳空间技术已在驱动真实世界突破
在AGBT会议期间的因美纳研讨会上,来自美国博德研究所、圣裘德儿童研究医院(St. Jude Children's Research Hospital)和转化基因组研究所(TGen)的研究人员将分享由全新空间组学技术带来的基于真实世界的研究进展与数据。
- 肺纤维化研究:转化基因组研究所生物创新与基因组科学部及空间多组学中心副主任Nicholas Banovich博士将分享他的研究成果,并强调高分辨率空间转录组学在揭示肺纤维化新型疾病机制方面的强大潜力。
"因美纳全新空间组学技术的规模和灵敏度使我们能够在大型组织切片中研究整个转录组。我们利用这项技术进行的早期分析已经识别并定位了与肺纤维化中上皮细胞活跃重塑有关的分子失调。这将有助于识别可用于阻止或减缓疾病进展的治疗靶点。" Banovich表示。
Banovich的海报《运用因美纳空间组学技术表征肺纤维化中的肺泡失调》将在AGBT会议上展示。
- 3D组织重建: 博德研究所Michal Lipinski博士领导的空间组学研究成功构建了小鼠大脑的3D重建,突破性实现了从一张切片上进行10次实验所能获得的数据广度,这在之前从未实现过。研究团队的摘要总结道, "实验表明,因美纳的全新空间组学技术可以为大规模实验提供一个高效的平台,并进一步提升空间分辨率。"
"大规模、无偏全转录组捕获是这一发现平台的理想组成部分,该平台能够在单次实验中找到新的标记基因,并同时在多个组织切片上进行验证。" Lipinski表示。
Lipinski的报告《大范围连续空间转录组分析可实现高分辨率和有限批次效应的高效组织特征描述》将于美国东部时间2月25日星期二晚上7:30至7:50在AGBT会议上展示。
- 前列腺癌研究: 圣裘德儿童研究医院空间组学中心主任Jasmine Plummer博士将展示她的研究成果,阐明高分辨率空间测序如何揭示前列腺肿瘤微环境中的变化。
"空间组学提供了组织的蓝图、细胞外基质的铺设以及细胞的结构视图," Plummer表示, "这种可视化能够为癌症进展提供重要的洞察。"
"有了这项新技术,我们仅需在两种底物上就能对数百万个细胞进行分析,并发现靶向方法中未包含的生物标志物," Plummer补充道,"转录覆盖率的提高使我们能够进行罕见细胞类型的分析,并发现这些罕见细胞类型与前列腺癌亚组中的疾病状态相关。"
- 母体大脑研究: 因美纳科学研究高级总监 Darren Segale 博士将于美国东部时间 2 月 25 日星期二晚上 8:30至8:50 在AGBT发表题为 《怀孕小鼠大脑高分辨率空间转录组图谱揭示与母性行为有关的区域性基因表达调控》的演讲。
总体而言,该解决方案将帮助消除空间组学研究的障碍,让研究人员更好地了解组织样本的潜在生物学特性,并对实验结果更有信心。
因美纳支持的研讨会将于美国东部时间2月24日中午12:00至下午1:30举行。整个 AGBT 会议期间,因美纳将在 Osprey Lounge 1 展示其端到端工作流程。
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